近些年，电镜在生物学中的应用得到显著的拓展，发展迅速。目前已在植物保护，良种繁育，动、植物品种鉴定、性状鉴别，成分分析，土壤改进，纸浆改性，木材加工，环境保护等多方面的科研中取得了显著成绩。因此，电镜已深人生物学的方方面面，以下简单举例说明。
一、 植物学
（1）应用电镜观察植物组织的超微结构，探讨其生长和发育机理，揭示植物结构与功能的关系，为改善植物功能和提高植物产量提供理论依据。徕卡显微镜
（2）观察植物器官在生长过程中的变异，为提高栽培技术提供依据。
（3）观察植物的花粉、果皮、种皮、叶子表皮等结构的特征，为抱粉学、植物分类学提供科学依据。
二、昆虫学
通过观察昆虫的器官和组织，从而加深理解它们在生理功能上的作用，为探索各种生命现象和生活规律提供依据，并为防治和消灭虫害，提供理论依据。
（2）用sEM电镜观察昆虫的微观特征，对昆虫分类学、昆虫生物学及虫害的预测、预报等提供重要依据。
三、微生物学
（1）观察研究细菌、支原体等微生物的超微结构形态，研究病毒的结构和生长发育，也为新病毒、类病毒的发现和辨别提供科研手段。
（2）研究真菌、放线茵、细菌等的结构形态．对其分类，判别科属相判断病源等都有着重要意义，尤其对病菌的活动、抱子发芽、侵入寄主的方式等，能获得进一步结果。
四、病理学
徕卡显微镜对动、植物，昆虫的细胞，组织和器官的超微结构病变进行研究，为防治提供科学依据。电镜放射白显影技术和免疫电镜技术应用较多。
五、木材学
（1）应用sEM进行木材超微结构的研究，可为树种鉴定、木材分类等提供依据。并为研究木材构造与林木生长环境与其利用价值提供依据。
（2）应用sEM对木材的改性、风化、腐朽的特性进行研究，可为木材的加工和综合利用提供新依据。
（3）应用TEM进行木材的进一步分类，为改进加工工艺，改变生长环境提供理论依据。
六、制浆造纸
（1）应用sEM电镜对造纸原料的超微结构变化进行研究，应用T则对纸浆填料的粒径大小和分散程度进行研究，为制定理想的制浆方法和探索合理的工艺条件提供理论依据。
（2）利用x射线显微分析技术对造纸用的胶料、填料、颜料和纸张进行分析和研究，为正确选择原料和设计工艺提供依据。徕卡显微镜
七、天然色素
观察天然色素的超微结构形态，对质量和种类进行准确的判别；在萃取过程中跟踪检测，可为制定色素生产工艺提供理论依据。
八、土壤学
（1）应用电镜对土壤的组成和分类进行研究，对土壤中的有毒物质进行判断，探讨土壤成分对植物生长发育过程的影响。
（2）应用X射线显微分析技术判断植物体内微量元素的分布、施肥和生长之间的关系。
九、环境保护
通过对动、植物器官、组织、细胞超微结构的观察，了解环境的污染情况以及污染物对生物体形成的影响机制，为保护人类的生存空间提供理论依据。
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