在离子色谱仪的日常使用中需要对其做周期性的维护，具体的维护部件主要有6个，分别是 滤头、恒流泵、进样阀、色谱柱、抑制器和电导检测器。
滤头的维护主要是进行经常性换水，以免生出藻类和菌类堵塞滤头，造成系统压力升高恒流泵的维护主要是在每天对泵头进行清洗和后冲洗，因为清洁到位不容易使恒流泵出现腐蚀等情况。
进样阀的维护主要是进行一些清洗工作，避免残留和污染，清洗完后想办法盖上进样口，防止灰尘污染。
色谱柱的维护主要是在淋洗液的环境中密封保存。
抑制器的维护是内部要保持湿润，所以如果长期不使用一定要定期进行冲洗。
电导检测器的维护主要是定期通水维护。
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