m5C高分-m5C甲基化修饰技术研究方向汇总（一）

前言
RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA甲基化的研究已进行的如火如荼，但除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m5C甲基化修饰在近期的研究中也不断有高分文章的出现（如表1）。云序生物是国内RNA修饰测序的领跑者，可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前，云序已累计支持客户发表29篇高水平文章，合计影响因子191.25分，是国内支持发文多、累计影响因子高的公司。
2020年10月，发表在《Trends in Plant Science》上关于m5C的文章对m5C修饰在植物发育和环境适应中的作用进行了阐述。此外也有多篇文章报道了m5C在众多研究方向的机制。那么这个新领域具体有哪些进展？有哪些新型的方法思路值得我们借鉴呢？小编汇集了多篇m5C修饰文章，带大家把握这一领域的新进展。

文章内容
1. m5C——m5C修饰的控制植物发育和环境适应
发表期刊：Trends in Plant Science
影响因子：14.416
发表时间：2020.10
文章链接：RNA5-Methylcytosine Controls Plant Development and Environmental Adaptation 
尽管对RNA上的5-甲基胞嘧啶(m5C)在哺乳动物中的研究越来越多，但m5C在植物中的功能仍然不清楚。先前有研究者提出了m5C在植物发育和胁迫适应中的动态功能，此外Tang等研究者现在已经发现RNA m5C甲基转移酶在水稻高温适应中的作用。目前，已有几种新的方法被应用于RNA m5C的鉴定包括MeRIP-seq，RNA-BisSeq， Aza-IP和miCLIP，其中最后两个方法尚未应用于植物。最近使用m5C-RIP-seq、RNA- Bis-seq和Nanopore-seq研究了m5C表达谱及其在植物RNA代谢、发育和应激反应中的作用。本文通过m5C在拟南芥和水稻mRNA中的位置、功能和靶向性的探讨，表明了m5C在拟南芥和水稻根系发育调控中起着至关重要的作用。

图例：5-Methylcytosine (m5C)修饰及其在植物发育和环境适应中的作用。

2. m5C——m5C修饰的mRNA造成DNA损伤促进了同源重组
发表期刊：Nature Communications
影响因子：12.121
发表时间：2020.06.05
文章链接：m5C modification of mRNA serves a DNA damage code to promote homologous recombination
补充DNA修复蛋白到DNA损伤部位是DNA修复的关键步骤。DNA损伤位点的转录后修饰造成DNA错误编码从而招募了特定的DNA修复因子。文中作者发现m5C在DNA损伤位点对mRNA进行了局部修饰。RNA甲基转移酶TRDMT1被招募到DNA损伤位点并促进m5C的修饰。TRDMT1的缺失破坏了同源重组(HR)并增加了细胞对DNA双链断裂(DSBs)的敏感性。在没有TRDMT1的情况下，RAD51和RAD52无法定位到活性氧(ROS)诱导的DNA损伤位点。在体外，含有m5C修饰的RAD52对DNA的亲和力增强。肿瘤细胞中TRDMT1的缺失使其在体内和体外对PARP抑制剂更敏感。这些结果揭示了TRDMT1- m5C修饰能促进同源重组（HR），说明RNA转录后修饰也可以造成DNA损伤从而调节DNA修复。

图例：m5C mRNA的甲基化富集于DNA损伤的转录活性位点。