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荧光共振能量转移FRET肽和寡核苷酸荧光标记的应用-1

2021.3.01
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

     荧光染料标记的肽和寡核苷酸是生化和细胞研究中的重要工具,目前荧光肽和寡核苷酸已广泛用于所有主要类型的荧光成像中,包括荧光共振能量转移(FRET),这些标记的生物分子被广泛用于基于分子信标和其他技术的传染病诊断。FRET肽和寡核苷酸也已通过荧光相关细胞分选(FACS)用于细胞分析,用于体内或体外的研究和诊断目的。

 

       肽和蛋白质分子量计算器:

 

       为了帮助您计算寡肽和蛋白的分子量,请使用我们的在线计算器,肽和蛋白质分子量计算器:https://www.aatbio.com/tools/calculate-peptide-and-protein-molecular-weight-mw

 

       用于荧光标记染料

 

       根据肽/寡核苷酸的序列,可以通过共价键将荧光染料在特定点连接至肽/寡核苷酸。染料和肽/寡核苷酸之间的连接是共价键,在大多数生物学条件下较稳定且不会被破坏。在某些情况下,在染料和肽/寡核苷酸之间引入功能性接头来使肽/寡核苷酸生物活性改变最小,对于所有的肽/寡核苷酸标记,染料都必须连接在确定的位置。通常,优选的荧光标记应具有高的荧光量子产率并保留未标记生物分子的生物学活性。

 

v我们为大家提供了多种类型荧光标记染料,便于染料与用于生物学研究的肽/寡核苷酸的结合,这些荧光染料包括香豆素,荧光素,罗丹明和花青素,其中,我们的Tide Fluor™,California Red™,SunRed™和Helix Fluor™染料经过优化,可标记肽和寡核苷酸。

 

       花青素染料家族和其他经典染料

 

 

       图1.将 HeLa细胞与tubulin抗体孵育,然后与Cy5®山羊抗小鼠IgG偶联物(红色)一起孵育。细胞核用Hoechst 33342(蓝色,Cat# 17530)染色。

 

       尽管现代染料(例如iFluor™染料)通常用于更具挑战性的生物学应用,但经典的荧光标记染料有时因其较低的成本而非常适用于某些要求不高的应用。在经典的标记染料中,cyanines是最受欢迎的选择之一,其他染料包括FAM,TAMRA和TexasRed®,也都可以用于偶联肽和寡核苷酸。

 

       花青素染料家族和其他用于荧光标记染料的经典染料:

 

花青染料 激光 Ex / Em(nm) 滤光片组 消光系数(ε) 量子产率(Φ)
Cy3 532 nm 554/568 nm Cy3 / TRITC 150,000 0.15
Cy5 633-647 nm 650/669 nm Cy5 250,000 0.27
Cy7 730 nm 754/778 nm Cy7 250,000 0.3

 

Tide Fluor™系列染料

 

Tide Fluor™染料经过优化,可作为开发FRET寡核苷酸和肽的基础,我们的Tide Fluor™染料比香豆素,荧光素,罗丹明和花青素等经典标记染料具有更强的荧光,更高的光稳定性。

 

 

       用于荧光标记的Tide Fluor™系列染料:
 

贴标染料 Ex(nm) Em(nm) 消光系数(ε) 量子产率 CF260 CF280
Tide Fluor™1 345 442 20000 0.95 0.246 0.187
Tide Fluor™2WS 502 525 75000 0.9 0.211 0.091
Tide Fluor™2 500 527 75000 0.9 0.288 0.201
Tide Fluor™3WS 555 565 150000 0.105 0.079 0.079
Tide Fluor™3 555 584 85000 0.85 0.331 0.201
Tide Fluor™4 590 618 90000 0.91 0.489 0.436
Tide Fluor™5WS 649 664 250000 0.25 0.023 0.027
Tide Fluor™6WS 676 695 220000 0.18 0.111 0.009
Tide Fluor™7WS 749 775 275000 0.12 0.009 0.049
Tide Fluor™8WS 775 807 250000 0.08 0.103 0.109

 

       CF260是染料在260 nm处的校正因子,用于消除染料对260 nm处的吸光度的影响(用于寡核苷酸和核酸标记)

 

       CF280是染料280 nm处的校正因子,用于消除染料对280 nm处的吸光度的影响(用于肽和蛋白质标记)

 

       其他系列染料

 

       我们的California Red™,Sunnyvale Red™和Helix Fluor™染料非常适合对寡核苷酸和肽进行强大,高效的标记。这些系列具有改进的性能和亮度,仍然与传统的荧光标记染料(例如FAM,TET,VIC,JOE,NED,TAMRA和ROX)检测平台兼容。

 

       其他荧光标记系列染料:

 

货号 产品名称 Ex(nm) Em(nm) 规格
250 Helix Fluor™545,琥珀酰亚胺酯 525 545 1mg
251 Helix Fluor™575,琥珀酰亚胺酯 546 575 1mg
394 Sunnyvale Red™SE *替代6-ROX * 576 605 5mg
473 California Red™ SE 583 603 5mg
479 California Red™ SE 583 603 1mg

 

       不用于荧光标记的染料

 

       蛋白酶参与许多生理过程, 蛋白酶的检测和特定蛋白酶抑制剂的筛选对于发现用于治疗和管理蛋白酶相关疾病的潜在药物至关重要,各种供体和受体分子(荧光的或非荧光的)附着在肽/蛋白质上(形成内部淬灭的结合物),并根据氨基酸序列用于检测蛋白酶。精心选择供体和受体分子,使受体的激发波长与供体发射波长重叠,从而确保荧光通过共振能量转移而淬灭,底物的酶水解导致供体和受体分子的空间分离,从而恢复供体荧光。

 


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