飞行喷墨式生物芯片点样技术在超高通量抗体芯片开发的应用
上海交通大学系统生物医学研究院3月12日报道，国际知名期刊Science
Advances在线发表了上海交大陶生策团队，Abmart孟逊团队和西北大学联合研究的最新研究成果：An Array of 60,000
Antibodies for Proteome-Scale Antibody Generation and Target Discovery。
在该研究中，作者采用Arrayjet
Marathon飞行喷墨式生物芯片点样仪开发了一款包含62,208种单克隆抗体的超高通量抗体芯片PETAL
array，并利用抗体的多特异性（multi-specificity）去发现和寻找新抗体。该芯片被用于了蛋白质组水平的抗体制备、表型相关蛋白质筛选以及肿瘤药物靶向蛋白的发现等。这些单克隆抗体的免疫原来自400+类物种的3000+种蛋白质的15000+个线性表位，通过30000+万只小鼠的免疫、骨髓瘤细胞融合和筛选，最终形成了一个具有高度多样性、经过亲和力成熟的抗体库。
该研究基于所建立的抗体库，构建超高通量的抗体芯片，并联合质谱建立了规模化抗体制备以及鉴定表型相关蛋白质的技术。首先，研究人员建立了规模化抗体制备的流程。基于高通量抗体芯片进行细胞膜蛋白或核蛋白提取物的分析，然后采用pull-down联合质谱逐一鉴定阳性抗体所识别的抗原。
超高通量抗体芯片和抗体筛选方法学的建立
论文的通讯作者之一上海交通大学陶生策教授表示：“抗体芯片技术过去一直有相关研究和应用，但之前的抗体芯片一般最多包含有约1000多种抗体，本研究中开发的抗体芯片上包含的抗体数目是其60多倍，使得抗体芯片技术应用的广度和深度实现了巨大的进步。”
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