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DNA编码化合物库技术的学习和追踪“神器”——DELFinder

2021.3.22
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编辑杰

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  实际应用案例

  近日,Scott E. Wolkenberg博士团队利用药明康德HitS事业部自主开发并运维的DELFinder搜索引擎和DELopen平台,顺利完成DEL相关领域论文的检索工作,并成功在《ACS Medicinal Chemistry Letters》杂志上发表论文。

  近年来兴起的DNA编码化合物库(DNA-Encoded Library)技术,基于独特的组合化学原理,将小分子化合物和DNA标签相结合,受到越来越多学术界和工业界药物研发人员的关注与青睐,在新药发现领域发挥着越来越重要的作用。

  由于DEL技术是化学、生物学、信息学的多学科跨界创新产物,通过主流数据库来检索相关文献,会遇到很多的干扰信息,想找有用的资料来了解和学习DEL技术困难重重。

  2020年1月3日,DELopen团队自主开发并上线了一款专用于DEL领域的学术搜索引擎——DELFinder,免费为全球研发人员提供关于DEL技术的数据信息检索服务。

  近日,Scott E. Wolkenberg博士团队使用DELFinder工具,完成DEL相关论文的检索工作,并在ACS Medicinal Chemistry Letters杂志上发表了综述性文章《Trends in Hit-to-Lead Optimization Following DNA-Encoded Library Screens》[1]。

  该篇综述首先对DEL筛选和传统的HTS(High Throughput Screening,高通量)筛选进行简要概述和对比,同时检索并筛选大量已发表的DEL筛选和HTS筛选相关文献,通过归纳和分析大量文献数据,类比了由DEL筛选或HTS筛选获得的苗头化合物以及后续的先导化合物优化的流程和效果,具体分析了包括BRD4、DDR1和BETm等靶点的优化案例。

  值得注意的是,该篇综述同时使用了SciFinder和DELFinder进行文献检索和收集。其中,2016-2020年间的DEL技术相关文献均来自于DELFinder的检索结果。

  在杨森(Janssen)公司研发部工作的Wolkenberg博士高度认可由药明康德HitS事业部开发并运维的DELFinder搜索引擎和DELopen平台,并评论道:“DELopen平台的资源非常棒,衷心感谢药明康德团队为此做出的努力和贡献。”

  由DELopen团队开发的学术搜索引擎——DELFinder,致力于为全球研发人员提供所有关于DEL技术的数据信息检索服务[2]。

  DELFinder收录了公开报道的与DEL相关的所有文献、ZL、书籍、博士论文、会议论文、行业新闻、临床报告等数据信息。研发人员可以通过筛选条件,如文献类型、企业/学术机构、发表日期、数据库来源等,或者输入关键字,快速、精准地检索到想要的DEL相关文献或报道,通过提供的原文链接获得相关信息,从而学习和追踪DEL技术的研究进展和最新应用。

  为满足全球科研用户的需求,DELFinder不断升级迭代。

  最新版DELFinder 2.0的检索界面:不仅会显示文章信息,该文献相关的DEL Library,DEL Hit及DNA Compatible Chemistry也会被明确列在检索到的文献页,并配以简明图示,辅助用户快速理解文章。真正做到不用登录,无需阅读原文,即可轻松掌握每篇文献的关键信息,大大缩短了精准检索所需文献的时间[3]。此外,DELFinder 2.0中的推荐指数也为用户筛选全球最前沿最优质的DEL科研成果提供了便利。

  DELopen平台是药明康德HitS事业部基于合作、赋能、创新等理念,联合医药研发领域顶级学术研究机构共同发起的、致力于推动DEL技术应用和开发的开放式新药研发合作平台。

  DELopen平台的突出特点是其公益性和互动性。它面向的是全球所有高校、研究所和非盈利组织等学术机构,科学家们可以通过DELopen平台与工业界合作,利用DEL技术高效地完成早期药物发现,协作推动全球生物制药领域科学和技术的发展,最终造福广大病患。

  而依托DELopen平台的“DELopen新药筛选包”,是药明康德HitS事业部于2018年12月推出的自助式DEL筛选试剂盒,现已服务全球百余家学术机构,多个机构已经成功找到相关靶点的苗头化合物(Hit),并成功开启后续的药物研发工作。药明康德“DELopen新药筛选包”项目荣获第五届 “社会价值共创”优秀奖[4]。


药明康德
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