幼虫即棘球蚴，为圆形囊状体，随寄生时间长短、寄生部位和宿主不同，直径可由不足1cm至数十厘米。棘球蚴为单房性囊，由囊壁和囊内含物（生发囊、原头蚴、囊液等）组成。有的还有子囊和孙囊。囊壁外有宿主的纤维组织包绕。
囊壁分两层，外层为角皮层（laminated layer），厚约1mm，乳白色、半透明，似粉皮状，较松脆，易破裂。光镜下无细胞结构而呈多层纹理状。内层为生发层（germinal layer）亦称胚层，厚约20μm，具有细胞核。生发层紧贴在角皮层内，电镜下可见从生发层上有无数微毛延伸至角皮层内。囊腔内充满囊液，亦称棘球蚴液（hydatid fluid）。囊液无色透明或微带黄色，比重1.01～1.02，pH6.7～7.8，内含多种蛋白、肌醇、卵磷脂、尿素及少量糖、无机盐和酶，对人体有抗原性。
生发层（胚层）向囊内长出许多原头蚴（protoscolex），原头蚴椭圆形或圆形，大小为170×122μm，为向内翻卷收缩的头节，其顶突和吸盘内陷，保护着数十个小钩。此外，还可见石灰小体等。原头蚴与成虫头节的区别在于其体积小和缺顶突腺。生发囊（brood capsule）也称为育囊，是具有一层生发层的小囊，直径约1cm，由生发层的有核细胞发育而来，据丁兆勋等观察，最初由生发层向囊内芽生成群的细胞，这些细胞空腔化后，形成小囊并长出小蒂与胚层连接。在小囊壁上生成数量不等的原头蚴，多者可达30～40个。原头蚴可向生发囊内生长，也可向囊外生长为外生性原头蚴。
生发囊（brood capsule）也称为育囊，是具有一层生发层的小囊，直径约1cm，由生发层的有核细胞发育而来，最初由生发层向囊内芽生成群的细胞，这些细胞空腔化后，形成小囊并长出小蒂与胚层连接。在小囊壁上生成数量不等的原头蚴，多者可达30～40个。原头蚴可向生发囊内生长，也可向囊外生长为外生性原头蚴。
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