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新生隐球菌的检测方法有墨汁负染法，如脑脊液标本检查。乳胶凝集试验用于检测新生隐球菌的荚膜多糖抗原，可以检测脑脊液、血液及其他体液标本。该试验具有很高的特异性和敏感性，是少数可以*免疫学方法诊断的真菌性疾病。该试验还可以检测滴度，对疗效监测和估计预后有一定的指导意义。咖啡酸试验:新型隐球菌可产生深棕色色素。
尿酶试验:新生隐球菌能够产生尿素酶，常用Christensenurea agar 培养,新生隐球菌产生的尿素酶分解尿素，使培养基变为红色。
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