一、选择适合的加热介质。氮吹仪的加热介质采用蒸馏水和去离子水，这将合理有效避免 在水浴内壁形成水垢。注意不可以应用有机溶剂作加热介质，有机溶质挥发有着毒性，会对身体健康形成伤害。
二、应用除藻剂净化水浴。试验结束后，不加热时，在水浴的水里添加除藻剂，可避免 水浴池中的生物被污染。在采用除藻剂时，应保证所使用除藻剂不会影响到所要处理的样品性质，且不可应用酸性除藻剂。
三、按时换水。氮吹仪长时间实验形成的杂质，及其空气中的污染物都将污染的水质，不但会形成水垢，还可能影响到实验的准确度和速率。因而，水浴中的水建议一周一换，尽可能不可以超出一个月。
四、酸性环境防护。当接触或暴露于酸性材料、蒸汽或样品后，应该马上清洗，用适当的碳酸氢钠溶液或其余类似溶液中和，再用清水清洗。长时间接触酸性物质，可能毁坏仪器。如一定要长时间接触酸性物质，则应采用防护措施。
五、清洗针头。氮吹仪每一次应用完针后都应该应用有机溶剂清洗、高压消毒清洗针头，尽可能减少针的污染，及其对后期实验的影响到。
六、严禁长时间浸没。氮吹仪浴底耐水但不防水。在试验结束后，应及时将该设备取出来擦拭干净，千万不能将水浴浸泡在任何液体中，或摆放在可能出现浸泡的地方。
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