根系分析系统对根系图像进行多参数的自动分析，为研究提供可靠准确的数据。根系分析系统主要由数码扫描成像系统、分析软件和电脑组成。根系分析系统测量项目：根总长；根平均直径；根总面积；根总体积；根尖计数；分叉计数；交叠计数；根直径等级分布参数；可不等间距地自定义分段直径，自动测量各直径段长度、投影面积、表面积、体积等，及其分布参数；根尖段长分布。
根系分析系统能进行根系的颜色分析，确定出根系存活数量，输出不同颜色根系的直径、长度、投影面积、表面积、体积；能进行根系的拓扑分析，自动确定根的连接数、关系角等，可单独自动分析主根或任意一支侧根的长度和分叉数等；自动分析根系分级伸展的等级分布情况，可达到5级侧根的自动分析；可单独显示标记根系的任意直径段相应各参数（分档数、档直径范围任意可改）；能用盒维数法自动测根系分形维数。
大批量的全自动根系分析，可对各自动分析结果图进行编辑修正；能进行根的分叉裁剪、合并、连接等修正，修正操作能回退，以快速获得100%正确的结果。精度：根长≤±1%；面积：优质图像质量时<1%，标准图像质量时≤3%；匹配专门的双光源照明系统，提供高分辨率的彩色或黑白图像，去除了阴影和不均匀现象的影响，有效保证图像质量；采用非统计学方法测量计算出交叉重叠部分根系长度等，可保存或读取TIFF、BMP、PNG、JPEG、PCX标准格式的图像。可兼做针叶面积、体积测量，以及棉纤维粗细、长度测量。
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