在抗结核治疗中应选用高效、敏感、低毒的药物，方案中至少包含3种杀菌药物，异烟肼和利福平是最重要的基本药物，再加吡嗪酰胺和其它药物联用，达到杀菌灭菌和减少复发的作用，成为标准的抗结核短程化疗方案。
化疗方案的确立：需依据患者痰中是否有排菌，既往是否有抗结核治疗过，治疗多长时间以及现阶段的病情而定。比如：是初次治疗还是或复治或是慢性排菌还是耐多药病人，治疗方案都有不同。
我国目前采用的是直接观察下的短程督导化疗。服药方法是隔日服药。
短程督导化疗分为两个阶段：强化期和继续期。
强化期为杀菌阶段，即在治疗开始时的2—3个月，联合应用4—5种抗结核药，以便在短时间内尽快杀灭大量繁殖活跃的敏感菌，减少耐药菌的产生。
继续期即巩固期，在强化期之后的4—6个月内，继续消灭残留的结核菌，并减少和避免复发机会。
根据病人不同情况，在治疗中也有延长治疗阶段的做法，主要是根据病人的痰中是否还有排菌而定。
用药方式有三种类型：（1）全程每日用药；（2）强化期每日用药，继续期间歇用药；（3）全程间歇用药。
各类型结核病化疗方案与选择（在以下方案中、药物名称前数字表示服药月数，右下方数字表示每周用药次数）：
1、初治菌阳肺结核：即（1）痰中查到结核菌（含涂片或培养）的肺结核病人，从未因结核病应用或试用过抗结核药物治疗者；（2）因结核病应用或试用过抗结核药物治疗但不足一个月者；（3）新发病有空洞或粟粒型初治菌阴肺结核病人；（4）或是菌阴肺结核病人，经抗结核治疗不到一个月转为涂阳的病人。
主要推荐短程化疗方案为：2H3R3Z3E3 /4H3R3
强化期：异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙氨丁醇隔日1次，共2个月。
继续期：异烟肼、利福平隔日1次，共4个月。
治疗中如痰菌持续不能阴转，可适当延长疗程。血行播散性结核病需增加疗程至12个月为宜。
2、初治菌阴肺结核：主要推荐短程化疗方案为：2H3R3Z3/4H3R3
强化期：异烟肼、利福平、吡嗪酰胺隔日1次，共2个月。
继续期：异烟肼、利福平隔日1次，共4个月。
3、复治菌阳肺结核：主要推荐短程化疗方案为：2H3R3Z3E3S3/6H3R3E3
强化期：异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙氨丁醇、链霉素隔日1次，共2个月。
继续期：异烟肼、利福平、乙氨丁醇隔日1次，共6个月。
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