质谱仪器是将分子转化成各种离子，并按正离子与电荷的比例大小将它们分离，同时记录和显示这些离子的相对丰度。
质谱仪器主要由进样系统、离子源、质量分析器及检测器几个部分组成。此外，还有真空系统及电源。
如图：
进样系统 质谱仪器对分样品的物态没有什么特殊要求，无论是固体、液体及气体样品，只要能汽化，均可进行分析。但对其纯度要求很高，对于气体样品，因本身就是分子状态，可以通过调节进样速度，直接进样送入离子源。液体样品需要预热挥发汽化再进入离子源。然而有机化合物大多数样品为固体，星现结晶状态，蒸气压小，挥发性差，因此需配备特殊装置，先将样品在减压加热的情况下汽化，然后再进入离子室。
进样系统分为直接进样系统、间接进样系统和分子分离器三类，其中分子分离器(又称载气分离器)是与色谱仪联用时的特殊进样系统，它的作用是将由色谱仪器流出物中的载气除去，而只让样品组分进入质谱仪器的离子源。
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