一、微生物相关概念：
微生物包括细菌、病毒、真菌和少数藻类等。（但有些微生物是肉眼可以看见的，像属于真菌的蘑菇、灵芝等。）病毒是一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的“非细胞生物”，但是它的生存必须依赖于活细胞。
在人的体表及与外界相通的口腔、鼻咽部、肠道、泌尿生殖道等腔道中寄居着微生物，在正常情况下对宿主无害而有益，这样的微生物为正常微生物群，其中以细菌为主，通称正常菌群。
二、病原菌：
是指能入侵宿主引起感染的微生物，包括细菌、真菌、病毒等。病原菌按致病性分类如下：
1、致病菌:
致病菌（种类少，毒力强）
2、条件致病菌:
（种类多并在不断增加，毒力弱）
三、微生物检测
是指从病人的痰、尿、血液、穿刺液（胸腹水、关节液、心包液）、脑脊液、化脓及创伤口等处获取原液，扩大培养，鉴定菌种，最终确定抗生素的种类和浓度（药敏试验）的一整套流程。我国医疗机构常规临床微生物检测项目有 7 类。1.细菌检测2.真菌检测3.衣原体检测4.支原体检测5.梅毒螺旋体检测6.病毒检测7.其它检验试验。
微生物诊断流程
四、微生物诊断技术
1、传统诊断技术：生化检测和免疫检测
2、PCR技术：
聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction，PCR)是指在 DNA 聚合酶催化下，以母链 DNA 为模板，以特定引物为延伸起点，通过变性、退火、延伸三步骤，在体外复制出与模板互补的子链 DNA 的过程。它具有特异性强、灵敏度高、重复性好等突出优点，能在短时间内将目的基因片段扩增至十万乃至百万倍。
3、质谱检测技术：
质谱技术鉴定微生物是利用已知的菌种建立数据库，通过对待测样本进行检测，获得其蛋白质图谱，再将所得的质谱图与数据库中的微生物参考图谱进行比对，从而得到鉴定结果。其检测流程一般分为三个部分：1）临床样本的预处理；2）样本上机检测；3）对比蛋白质指纹图谱数据库得出鉴定结果。
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