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质谱信号的强弱和检测器检测到的离子流强度有关,而离子流的强弱跟物质的分子结构还有仪器类型有关系,比如做EI,如果样品挥发性好、在质谱离子源内能很好的离子化,得到的信号就很强;相反,如果样品分子量或极性很大,高沸点不易挥发,在离子源内很难被离子化,得到的信号就会很低。但是如果把极性大的样品放在ESI里来做,就可能得到很强的信号。所以说,做质谱分析首先要根据样品的结构性质来选合适的分析仪器。