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链霉亲和素是四聚体蛋白，大小为66KDa。一分子链霉亲和素可以高度特异性地与四分子生物素结合，两者之间的亲和力极为强烈，链霉亲和素-生物素复合物的解离常数处于 10 mol/L 数量级，这一性质常用于分子生物学用途 。其中一条完整的SA肽链中有159个氨基酸残基，分子量为16450。
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