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Hcy升高直接导致血管内皮损伤出现血管粥样硬化：通过产生超氧化物及过氧化物损伤血管内皮细胞，改变凝血因子功能，增加血栓形成倾向；使小动脉血管易于栓塞，促进血管平滑肌细胞增殖，参与粥样硬化形成；活化形式促使血小板聚集，与载脂蛋白B致密复合，血管壁巨噬细胞吞噬，引起血管壁脂肪堆积。如果血浆Hcy持续浓度太高，甚至会直接导致器官衰竭死亡。
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