ATP荧光检测仪基于萤火虫发光原理，利用"荧光素酶-荧光素体系"快速检测三磷酸腺苷(ATP)。由于所有生物活细胞中含有恒量的ATP，所以ATP含量可以清晰地表明样品中微生物与其他生物残余的多少，用于判断卫生状况。
手持式ATP荧光检测仪用途广泛，可用于: 食品、医药卫生、医药、日化、造纸、工业水处理、国防以及环保、水政、海关出入境检疫及其他部门等多种行业 。
手持式ATP荧光检测仪的使用的规范性：
1、仪器为了满足现场快速检测的需求，ATP 荧光检测仪宜选择手持式从而实现流动状态即时检测。
当仪器和试剂配合使用，整体灵敏度达到10‐15‐10‐18摩尔ATP范围时，可以用于食品表明微生物检测、手卫生检测、餐饮器具洁净度检测、重点科室和重要活动场所物表检测和卫生安保、食品加工器具、工作台等关键控制点消毒结果检测、医疗环境工作平台(器械表面、内窥镜、空调进出气口)卫生学即时评估，其实时监测数据能有效配合HACCP或GMP体系管理的要求 。
2、试剂 专用的 ATP 试剂盒，必须是可去除游离 ATP 和体细胞 ATP，只针对细菌细胞 ATP 检测，所谓去除干扰物，这是基本要求。其次荧光素酶、虫萤光素、裂解液、取样拭子等组分最好设计成一体化，整体便于现场携带方便检测使用。
3、如何使用
取样是影响准确性和一致性的关键之一，可按照<<医院消毒卫生标准采样及检查方法>>等规范要求再参照手持式ATP仪说明书采样、检测、计算得出结果并记录报告。
采样：
(面积类)将ATP拭子采样棒一支在物体表面或双手指曲面从指跟到指端来回涂擦个两次(一只手涂擦面积约30cm2)，并随之转动采样拭子。
(体积类)将 ATP 拭子采样棒一支在待测液体充分浸湿。
检测：将拭子放入手持ATP仪，获得被测样本与细菌污染程度相对应的ATP生物荧光值，得出菌落数指标。
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