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nanoporetech 使用纳米孔测序技术的微生物学

2021.9.26
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空空

好好工作,天天开心

完整的细菌,真菌和病毒(DNA或RNA)基因组,可进行长时间的纳米孔测序。通过快速的病原体检测方法(无论是在实验室还是在野外),从环境或单一生物样品中鉴定并鉴定微生物。如果需要,还应附有抗菌素耐药性分析。使用直接RNA或cDNA方法对全长转录本进行测序,以进行准确的基因表达和转录本亚型分析。

 

 

 

全面分析微生物基因组(DNA或RNA)。准确定位重复区域和结构变异,并使用长测序读数将质粒与基因组区分开。简化从头组装并更正现有的参考基因组。可扩展以适应您从工作台到现场的需求。

 

 

实时准确识别微生物和相关的抗药性(AMR)。Oxford Nanopore提供了完整的解决方案-从快速的10分钟文库制备(DNA)到使用EPI2ME平台的实时系统发育和AMR分析。使用宏基因组或靶向16S rRNA方法。使用便携式MinION或台式GridION或PromethION设备在样品源处或实验室中进行测序。

 

使用全长纳米孔测序读数,解析转录本亚型并测量真实的基因表达谱。低投入量与快速,简化的工作流程相结合,可进行高度敏感的基因表达分析


微生物表现出许多类型的碱基修饰,可影响一系列功能,包括基因表达和抗菌素耐药性。与基于替代测序的分析方法不同,纳米孔测序不需要扩增或链合成,可以减少偏差并保留修饰的碱基信息,这些信息可以与核苷酸序列一起直接检测到-无需额外的样品转换。 

 


 




丁香通
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