与一级生物安全柜相同，气体是从外部进入到二级生物安全柜里边，一般称作
进流。进流可以避免在微生物操作时产生的气溶胶从安全柜的操作窗口疏散到实验室里
。与一级生物安全柜不同的地方是，只让经HEPA过滤的(无菌的)空气流过工作台面。内
置风机把空气经前面的开口引入安全柜内并进入前面的进风格栅。所以未通过过滤器过
滤的空气不能直接进入工作区，所以二级生物安全柜能够确保安全柜内部存放的样品及
仪器不被外部空气污染。
不同型号的二级生物安全柜的主要不同在于：排气的比例和气体经过空气高压
再循环的比例不同。此外，不同的二级生物安全柜各自具有不一样的排气方式：有的安
全柜将空气过滤后直接排到室内，有的是经过连接到通风管道上的套管或通过建筑
物的排风系统排到建筑物外面。
除此之外，所有的二级生物安全柜和一级生物安全柜一样，可以保护操作人员和实验室
环境不受危害。同样，二级安全柜也可以保证产品样本在微生物操作中不受污染。二级
生物安全柜可以在一，二，三级生物安全水平的生物因子操作中使用。
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