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在连接色谱柱之前，预先用即将使用的流动相体系置换以前用的流动相体系。
在连接色谱柱时，要赶走因色谱柱保存不当或长时间不用在色谱柱的进口或者出口处产生的一些气泡。
连接色谱柱要注意标示的色谱柱进出口方向。
如果分析所用的温度较高，应在较低的流速下比如0.2到0.3ml/min的流速下缓慢地升高温度，当温度达到设定温度后，再慢慢地增大流速至设定值。
如果色谱柱需要较长的时间才能平衡稳定，检查色谱柱连接处是否有漏液。
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