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气套式加热：气套式加热通过遍布箱体气套层内的加热器，对箱内气体进行加热。结构相较于水套式更简单，且往往配置了高温灭菌系统。此类培养箱不仅温度循环速度快，在因箱门频繁开关等原因，造成温度经常性波动时，仍能迅速恢复箱体内的温度至目标值。水套式加热：通过外套的独立热水间隔，包裹箱体的内部，维持温度恒定。热水通过自然对流，在箱体内胆间隔不断循环流动，传导热量以保持温度恒定。水作为一种很好的绝热物质，在仪器断电时，能较长时间保持箱内温度稳定，其维持的时间甚至是气套式加热培养箱的4~5倍。
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