1、往复泵的流量不均匀。这一特性对泵的吸排工作性能有不利影响，即：吸、排管路中液流速度不稳定而产生惯性阻力损失，使吸人阻力增大而容易引起汽蚀，并且使排出压力波动。常采用多作用泵和空气室来改善往复泵的供液不均匀性。
2、往复泵设有泵阀，在吸、排过程中泵阀的启阀阻力和流阻损失，会使泵缸内的吸人压力进一步降低而容易引起汽蚀，同时也会使排出压力升高。
3、转速不宜太高。电动往复泵转速大多限定在200—300r/min以下，一般最高不超过500r/min。提高往复泵转速虽然可以增加泵的流量，但会使活塞不等速运动的加速度和惯性力增加，使泵容易汽蚀且排出压力波动加剧；此外，泵阀也是限制转速的一个重要因素，转速过高会使泵阀启闭迟滞和撞击加剧，泵阀阻力也会增加等。若吸人阀阻力损失过大，甚至造成不能正常吸人。
4、被输送液体含固体杂质时，泵阀和活塞环容易磨损，或可能将阀盘垫起造成漏泄。必要时需设吸人滤器。
5、往复泵的结构较复杂，泵内需装设吸、排阀、因而易损件(如吸排阀、活塞环、活塞杆填料箱等)较多，维修量大。
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