藻类自动分析仪是一种用于环境科学技术及资源科学技术领域的海洋仪器，于2016年5月26日启用。
技术指标
主要技术参数： 1生物数量：±0.1%f.s（全量程的0.1%） 2 图像：大小量程：2μm～3mm，分辨率：0.5μm 3 测量流速：0.005ml/min～20ml/min 4激光系统：488nm固态绿色激光 5图像类型：24位真彩色 (彩色CCD) 6拍照速度：每分钟可以获取10000个颗粒的图像数据。
主要功能
藻类自动分析仪具备完成水中藻类分析的功能，具有显微摄像、动态图像、自动计数、体积监测的功能，可满足长期、稳定地进行海洋生物、淡水生物监测等工作。藻类自动分析仪同时接入流式影像系统、荧光体积监控系统的功能，可同时测量并记录每个颗粒的ESD、ABD、长度、宽度、长宽比和（或）荧光特性以及同性颗粒的数量和浓度等多达近40个参量的数字特征信息，可为浮游植物生态学调查提供了快速有效的数据分析手段。
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