色谱仪器分析准确度一般是包含分析结果的正确程度和重复程度两个方面，也就是说包括系统误差和随机误差的联合效应。
方法一：平行测定。
两份结果若相差很大，差值超出了允许差范围，这就表明两个结果中至少有一个应重新分析，两份结果若很接近，可取平均值，但不能说所得结果正确无误。对于气相色谱仪分析，一般称之为重复性，在色谱仪鉴定标准中有相关规定。
方法二：用标样对照。
在一批分析中同时带一个标准样品，如操作无误而标样分析结果与标样的参考值一致，说明本批分析结果没有出现明显的误差，那么这个分析结果基本是认可的。但分析试样的成分应与标样接近，否则不能说明问题。
方法三：用不同的分析方法对照。
这是比较可靠的检验方法。如用气相色谱仪测定农药残留含量的结果与质谱仪的结果取得了一致，则一般证明此结果是可靠的，反之，说明两种方法中至少有一种方法的测定结果不准确。
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