1.将送检的各种生物学检样，如毛发、血痕、精斑、人体组织或白骨等，把其中所含的DNA 提取出来。
2.选用与探针配对的限制性核酸内切酶，在长链DNA 位置上加以切割，将相对分子质量很大的DNA 长链切短成许多长度不同的小片段。
3.在胶板尺寸较长的凝胶电泳仪中，对完全酶解后的DNA 片段进行电泳，各酶切片段就会按其长度大小在电场中进行分离。
4.先用碱性溶液使凝胶板中分离开的双链DNA 片段变性为单链片段，然后将凝胶板夹在尼龙膜中，使这些单链DNA 片段印溃、转移并永久性地固定在尼龙膜上。
5.让放射性DNA探针与尼龙膜上的单链DNA片段进行分子杂交。
6.用放射性胶片与尼龙薄膜叠放，尼龙膜上的放射性探针便会发出X 射线使胶片曝光，从而使杂交有探针的长度不同的DNA片段位置显影在胶片上。这样的特征 DNA片段条状图谱，便是所谓的DNA指纹。
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