①根据所做的鉴定选择相应的鉴定卡：GN——革兰氏阴性杆菌鉴定卡；GP——革兰氏阳性菌鉴定卡；NH——苛养菌鉴定卡；YST——酵母菌鉴定卡；ANC——厌氧菌鉴定卡；AST-GN——革兰氏阴性杆菌药敏卡；AST-GP——革兰氏阳性球菌药敏卡；AST-YST——真菌药敏卡。
②根据所选鉴定卡配制相应浓度的菌悬液：
鉴定卡
GN：0.5～0.63麦氏单位；
GP：0.5～0.63麦氏单位；
NH：2.7～3.3麦氏单位；
YST：1.8～2.2麦氏单位；
ANC：2.7～3.3麦氏单位。
药敏卡
AST-GN：3.0mL盐水+145μL 0.5～0.63麦氏单位菌悬液；
AST-GP：3.0mL盐水+280μL 0.5～0.63麦氏单位菌悬液；
AST-YST：3.0mL盐水+280μL 1.8～2.2麦氏单位菌悬液。
③将调好浓度的菌悬液取3mL，放入一次性塑料试管中，将试管放入载卡架上。
④将相应的卡片按顺序放在载卡架上，将卡片的输样管插入到菌液管中。药敏卡应放在配对鉴定卡的后面。
⑤进入 VITEK2COMPACT 应用软件主界面。扫描载卡架条码或直接选取卡架号。扫描试卡条码，将鉴定试卡与药敏试卡链接，并输入标本信息。
⑥将载卡架放入仪器的填充仓，按“充入”，70s左右填充完毕。
填充完毕后，仪器的蓝色指示灯闪亮。将载卡架取出并放入装载仓。仪器自动扫描条码，审核所有输入的卡片信息是否正确，确认无误后自动进行封口和上卡。操作完成后，仪器口的蓝色箭头闪亮提示。如下所示。
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⑦仪器每隔15min自动阅读孵育仓内所有卡片，并将数据传入英文工作电脑，电脑分析所有数据并给予结果，确认无误结果可传至中文电脑，由操作者认可并发放临床报告。
⑧已完成的卡片由仪器自动卸载入废卡箱。
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