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奥密克戎出现更“人类化”的基因片段,可能导致免疫逃逸

2021.12.07
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百科网专家

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  由于Omicron突变株(B.1.1.529)发生了更多功能性突变,因此很可能对人类造成更大威胁。

  其中Omicron极强的传染性和潜在的免疫逃逸最令人忧虑。

  英国COVID基因组联盟(GOG-UK)公布的最新研究显示,Omicron突变株S蛋白的32个突变部位中,至少有3个与其传染性增强有关。

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(Covid Genomics UK Consortium (COG-UK) 昨天发布了 Omicron 突变株的 32 个突变(左)的新图像,并与Delta突变株(右)对比。他们展示了该变体的三个突变——H655Y、N679K 和 P681H,位于图像的右下方——这可以帮助病毒更容易地进入到人体。图源:每日邮报)

  Omicron也确实展现了更高的传染性。

  Trevor Bedford刚刚发表的Twitter指出,根据Gauteng地区Delta和Omicron的流行病学数据和他的模型对比,估算出Omicron突变株在南非的实时传播系数Rt大约为3-3.5;而Delta突变株在南非和美国的初始Rt是1.5


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(Omicro突变株飙升的传染率)

  2021年12月2日,OSF预印网站发布了位于美国剑桥的生物医学数据分析公司Nference Inc的研究论文,显示Omicron突变株有一个插入突变,其遗传物质很可能来源于导致普通感冒的HCoV-229E冠状病毒。

  但这段特殊的基因序列也存在于能导致艾滋病的人类免疫缺陷病毒(HIV)和人类基因组中,COVID-19;Omicron突变株;免疫逃逸

  研究者认为,这可能意味着Omicron突变株更容易传播,但相对来说症状更为轻微。

  该研究迅速受到各主要媒体的关注和解读。

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  研究者首先比较了Omicron突变株和既往突变株的基因组差异,发现Omicron的S蛋白有26个氨基酸突变,其中23个替换、2个缺失和1个插入。

  替换和缺失的突变在之前的突变株中均出现过,但是插入突变(ins214EPE)却是首次在新冠病毒(SARS-CoV-2)中出现。

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(突变对比)

  进一步单细胞RNA测序显示,该插入序列表达于普通感冒冠状病毒(HCoV-229E)。

  而早期研究显示,宿主的肺脏和肠道可以同时存在新冠病毒和普通感冒冠状病毒。研究者推测,可能由此为两种病毒重组创造了条件。

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(研究者推测的两种病毒重组)

  尽管这段插入基因序列引发了科学家和媒体的广泛兴趣,并看起来似乎确实“Omicron突变株更容易传播,但症状相对轻微”;但我们还是需要强调:对于突变株最重要的关键特征,传播能力、毒力免疫逃逸能力,目前仍没有一锤定音的数据。

  另外也需要看到,这篇预印论文尚未经专业的同行评议,且公布的论文缺乏Omicron这段“可能来自于普通感冒冠状病毒”基因序列发生过程及作用的确凿证据。

  根据世界卫生组织公布的消息,Omicron已经在全球38个国家和地区蔓延。

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  面对这个尚待研究的突变株,我们有理由担心会有更多恐怖的突变株会出现。

  我们更不能心怀侥幸,期待Omicron可能的“传染性强、却毒力弱”,从而取代Delta突变株。

  人类不能把自己的命运交给新冠病毒。

  更快速度普及疫苗接种,才是真正能够把人类从可怕的新冠病毒大瘟疫中解救出来的方法。


(本文来源:Hanson临床科研公众号)

Hanson临床科研公众号
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