电子电离
电子电离(electron ionization)是一种强电离手段，这种方法区别于软电离，而是一种强电离手段。使用钨丝产生电子，再由电子束直接轰击样本。这种方法的好处是，电离效率较高。坏处是会产生很多碎片。通过这些碎片来分析样本中的成分。[4]然而这种方法，在使用单质作为样本时，可以获得详细的样本信息，当样本成为混合物，比如大气的观测，这种方法只能做到定性的分析出硫酸根，硝酸根，有机物，无法定量。
无电离
大气中存在大量的分子离子，基于质谱仪的电荷选择原理，这些已经自身带电的分子离子可以直接送入质量选择器中。于是一种叫做常压耦合(Atmospheric Pressure interface, APi)的方法就产生了。[5]这种没有离子源的质谱通过直接对离子进行筛选，获得离子的组分。
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