1. 干热灭菌器可分为室验室器具用，生产制剂用，生产器具用干热灭菌设备。
2. 干热灭菌器按使用方式分为连续式和批量式，批量式干热灭菌设备如干热烘箱，可用于内毒素检验用玻璃、金属器具的灭菌和除热原，以及生产设备部件、生产器具的灭菌除热原；连续干热灭菌设备，如隧道烘箱，可用于小容量注射剂的生产。
3. 干热灭菌器按加热方式可分为：以辐射加热为主的热辐射式干热灭菌机和以对流加热为主的热层流加热式干热灭菌机等。
干热灭菌器主要有烘箱、干热灭菌柜、隧道灭菌系统等设备系统。其中，干热灭菌柜、隧道灭菌系统是制药行业用于对玻璃容器进行灭菌干燥工艺的配套设备，适用于药厂清洗后的安瓿瓶或其他的玻璃容器，主要用盘装的方式进行灭菌干燥。
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