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疏水层析根据蛋白表面疏水性的不同,利用蛋白质与疏水层析介质疏表面可逆的相互作用来分离蛋白。纯水状态下,任何疏水作用都太弱而不能导致配基与蛋白之间的相互作用。某些盐却可以增强疏水相互作用。高浓度的盐会增强相互作用,而低浓度的盐会降低相互作用。但是目前尚无被广泛接受的关于疏水相互作用层析机制的理论。
影响因素:环境温度,盐浓度。