FPLC为专门用来进行蛋白质、多肽及多核苷酸分离的系统，FPLC为近年来的一项重要革新，其除了对HPLC的快速、高分辨率等特性加以保持，并且其还具有柱容量大、回收效率高及不易使生物大分子失活等特性。所以近年来，其广泛应用于分离蛋白质、多肽及寡核苷酸等方面。伴随着HPLC的发展，有薄壳型填料和双扩散灌流型填料两种新型填料出现了，对于分离大分子物质，它们的优越性独特，从而大大拓展了FPLC的应用领域。其能够进行蛋白的含量的测定以及蛋白的分子量的确定，能够分离纯化蛋白、有机化合物，所以其在生物学领域和化学领域的研究可以得到使用。
近些年以来，在HPLC基础上发展出了新型色谱技术，包括低压液相色谱(LPLC)、中压液相色谱(MPLC)以及快速蛋白液相色谱(FPLC)，在这些新型色谱技术当中，快速蛋白液相色谱(FPLC)可以非常迅速地分离复杂混合物，能够在短时间内对大量样品加以纯化。其特性表现为较大的容量、较高的回收效率以及不易失活的生物大分子等。能够越来越广泛地使用于生命科学研究及药物生产上。
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