红外光是一种介于可见光区和微波区之间的电磁波，包括近红外光（NIR， 0.78～2.5μm）、中红外光（MIR，2.5～50μm）和远红外光（FIR，50～1000μm）。红外光谱中振动峰的数目、位置、形状和强度与被测物质的组成、结构、性质有密切联系。

研究表明，不同样品的红外光谱包含有不同的信息，即样品的红外光谱具有指纹性。在地理标志产品的检验中，通过对比不同产地的同类产品或其特定工艺条件下的提取物的红外光谱或其包含的信息，就可以实现对产品产地的鉴定。

由于红外指纹图谱反映的是食品或农产品整体质量信息，是基于整体性和模糊性的判别方法。当样品的红外光谱图具有指纹性时，可作为一级图谱进行对比鉴定；当不同产地的同类产品的图谱相似时，可借助化学计量学消除背景干扰，分辨重叠波谱，揭示波谱数据中隐含的物质信息，建立判别模式，对食品或农产品的产地信息进行更为准确的分析，为地理标志食品的检验提供科学依据。

常用的化学计量法有主成分分析（PCA）、偏最小二乘判别分析（PLS-DA）、聚类分析（CA）、线性判别分析（LDA）等。当样品量足够多时，可以采用多模式识别技术，以更准确地识别食品或农产品的产地及生境等。