如下图是色谱质谱联用仪的接口与色谱仪组成的进样系统示意图。样品由色谱进样器引入色谱仪，经色谱柱分离的各个组分依次通过接口进入质谱仪的离子源。最常用的是气相色谱质谱(GC/MS)和液相色谱质谱(LC/MS)两种进样模式。该进样系统的关键部分是接口，应满足以下三个条件:
GC/MS进样器
①接口不破坏离子源的真空，也不影响色谱柱分离的柱效(不增加色谱系统的死时间)。
②接口应能使色谱分离的各组分尽可能多地进入质谱仪离子源，而使色谱流动相尽可能不进入。
③接口的存在不改变色谱分离的各组分的组成和结构。GC/MS进样系统主要用于气体有机物的同位素测定，由GC分离的有机物，经燃烧炉焚烧后转变为C、H、O的氧化物，如二氧化碳和水，供质谱仪测定其同位素比和组成。
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