为了解土壤污染状况，可随时采集样品进行测定。如需同时掌握在土壤上生长的作物受污染状况，可依据季节或作物收获时期采样，一般在秋季作物收获后或春季播种施用前采集，果园在果实采摘后的第一次施肥前采集。面积较小的土壤污染调查和突发性土壤污染事故调查可随时直接采样。
样品采集按不同阶段又可分为：
(1) 前期采样：根据背景资料与现场考察结果，采集一定数量的样品分析测定，用于初步验证污染物空间分异性和判断土壤污染程度，为制定监测方案（选择布点方式和确定监测项目及样品数量）提供依据，前期采样可与现场调查同时进行。
(2）正式采样：按照监测方案，实施现场采样。
(3) 补充采样：正式采样测试后，发现布设的样点没有满足总体设计需要，则要进行增设采样点补充采样口
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