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1.两条反向平行的互补双螺旋链，一条方向为5‘→3’，另一条方向为3‘→5’，围绕同一中心纵轴，从右向上盘旋。
2.双螺旋磷酸-脱氧核糖主链在外，位于内的碱基平面与中心轴垂直。
3.每个碱基相聚0.34nm，同条链相邻碱基夹角36度，每10个碱基形成螺旋1周，螺距3.54nm。
4.露于螺旋外的磷原子离中心轴1.0nm，易与阳离子接近。
5.两条链相互碱基互补配对，即AT/GC，分别以2个和3个氢键相连。
6.两条单链之间有小沟，两个双链之间有大沟，他们在DNA双螺旋外交替出现。
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