根据科学惯例，溶酶体一词仅适用于动物的囊状细胞器，液泡一词适用于植物、真菌和藻类(有些动物细胞也有液泡)。自20世纪70年代以来，植物细胞的发现开始挑战这一定义。人们发现植物液泡在结构和功能上比以前认为的要多样化得多。 一些液泡含有自己的水解酶，并表现出典型的溶酶体活性，即自噬。因此，这些液泡被视为完成了动物溶酶体的作用。根据德杜瓦的描述，“只有当被认为是直接或间接参与细胞内消化的系统的一部分时，溶酶体一词才描述一个生理单位”，一些植物学家强烈认为这些液泡是溶酶体。然而，这并没有被普遍接受，因为液泡严格来说与溶酶体不相似，例如在它们的特异性酶和吞噬功能的缺乏方面。液泡不具有分解代谢活性，也不像溶酶体那样经历胞吐作用。
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