1、色谱柱平衡
如果观察到高效液相色谱保留时间漂移应首先考虑色谱柱的平衡，在每次运行前给足够的时间来平衡列平衡通常需要10~20柱的流动相，但如果在流动相中加入少量的添加剂(如离子对试剂)，则需要很长时间才能平衡流动相污染；
也可能是原因之一在流动阶段溶解的少量污染物可能会在柱上慢慢累积，造成滞留时间的漂移。需要注意的是，水是一种容易被污染的流动相成分。
2、固定相稳定性
即使在推荐的pH范围内使用，固定相的稳定性也受到限制。
例如，当所述二氧化硅基片是优选pH4的水解稳定性和流动相的水解速率和相关配体的类型。双官能和三官能配位体配体是比接合的单官能配体更稳定;短链键合的长链键合相比较稳定;相比要稳定得多烷基键合氰基键合相。
色谱柱的频繁清洗也加速了色谱柱固定相的水解。其他硅胶基质键合相也可以在水溶液中水解，例如氨基键合相。
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