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密码子的作用

2022.4.19
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zhaoqisun

致力于为分析测试行业奉献终身

密码表

首先,密码表不是生物的事实。而是基于已有的20个必需氨基酸首字母缩写,添加缺如的6个字母后得到的。依次根据氨基酸三字母缩写,中文译名拼音首字母寻找相关,再以其中密码子简并性(即重复性)最强的氨基酸为首选进行替代,具体变换为:

GCA,GCG:A→B

AGA,AGG:R→J

CCA,CCG:P→O

UUA,UUG:L→U

GUA,GUG:V→X

CAC :H→Z

对终止密码子亦进行了调整。需要强调,这一编码方案忽略了既有的B、Z的使用,以及忽略了终止密码子间真实的强弱性。

正向翻译备选方案

A:GCU,GCC.

B:GCA,GCG.

C:UGU,UGC.

D:GAU,GAC.

E:GAA,GAG.

F:UUU,UUC.

G:GGU,GGC,GGA,GGG.

H:CAU.

I:AUU,AUC,AUA.

J:AGA,AGG.

K:AAA,AAG.

L:CUU,CUC,CUA,CUG.

M:AUG.

N:AAU,AAC.

O:CCA,CCG.

P:CCU,CCC.

密码子表

Q:CAA,CAG.

R:CGU,CGC,CGA,CGG.

S:UCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGC.

T:ACU,ACC,ACA,ACG.

U:UUA,UUG.

V:GUU,GUC.

W:UGG.

X:GUA,GUG.

Y:UAU,UAC.

Z:CAC.

起始符:AUG【与M的编码相同,但之后需加空格(UAA)】

空格□:UAA

断句符:UAG

终止符:UGA

反向翻译:见图“修改后的密码表”

氨基酸特性

第一位碱基U

UUU (Phe/F)苯丙氨酸

UUC (Phe/F)苯丙氨酸

UUA (Leu/L)亮氨酸

UUG (Leu/L)亮氨酸

改错,苯丙氨酸 简写 F;缬氨酸 简写 V

UCU (Ser/S)丝氨酸

UCC (Ser/S)丝氨酸

UCA (Ser/S)丝氨酸

UCG (Ser/S)丝氨酸

UAU (Tyr/Y)酪氨酸

UAC (Tyr/Y)酪氨酸

UAA (终止)

UAG (终止)

UGU (Cys/C)半胱氨酸

UGC (Cys/C)半胱氨酸

UGA (终止)

UGG (Trp/W)色氨酸

第一位碱基C

CUU (Leu/L)亮氨酸

CUC (Leu/L)亮氨酸

CUA (Leu/L)亮氨酸

CUG (Leu/L)亮氨酸

CCU (Pro/P)脯氨酸

CCC (Pro/P)脯氨酸

CCA (Pro/P)脯氨酸

CCG (Pro/P)脯氨酸

CAU (His/H)组氨酸

CAC (His/H)组氨酸

CAA (Gln/Q)谷氨酰胺

CAG (Gln/Q)谷氨酰胺

CGU (Arg/R)精氨酸

CGC (Arg/R)精氨酸

CGA (Arg/R)精氨酸

CGG (Arg/R)精氨酸

第一位碱基A

AUU (Ile/I)异亮氨酸

AUC (Ile/I)异亮氨酸

AUA (Ile/I)异亮氨酸

AUG (Met/M)甲硫氨酸(起始)

ACU (Thr/T)苏氨酸

ACC (Thr/T)苏氨酸

ACA (Thr/T)苏氨酸

ACG (Thr/T)苏氨酸

AAU (Asn/N)天冬酰胺

AAC (Asn/N)天冬酰胺

AAA (Lys/K)赖氨酸

AAG (Lys/K)赖氨酸

AGU (Ser/S)丝氨酸

AGC (Ser/S)丝氨酸

AGA (Arg/R)精氨酸

AGG (Arg/R)精氨酸

第一位碱基G

GUU (Val/V)缬氨酸

GUC (Val/V)缬氨酸

GUA (Val/V)缬氨酸

GCU (Ala/A)丙氨酸

GCC (Ala/A)丙氨酸

GAU (Asp/D)天冬氨酸

GAC (Asp/D)天冬氨酸

GAA (Glu/E)谷氨酸

GGU (Gly/G)甘氨酸

GGC (Gly/G)甘氨酸

GCA (Ala/ A)丙氨酸

GCG (Ala/A)丙氨酸

GUG (Val/V)缬氨酸

GAG (Glu/E)谷氨酸

GGG (Gly/G)甘氨酸

GGA (Gly/G)甘氨酸 [10]

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