轴丝动力蛋白可以使纤毛和鞭毛滑动，轴丝动力蛋白只在有纤毛和鞭毛结构的细胞中发现。而细胞质动力蛋白则在所有的动物细胞和绝大部分植物细胞中发现。细胞质动力蛋白履行细胞生存所必须的职能，如物质运输和中心体装配。细胞质动力蛋白可以沿着微管进行性移动，即动力蛋白其中一个杆总是链结在微管上，依靠这种方式，细胞质动力蛋白可以持续移动很长距离而不与微管分离。细胞质动力蛋白同样有助于对高尔基体和其他细胞器的定位。它同样可以帮助内质网、溶酶体进行物质运输。动力蛋白也可能参加了染色体的定位与细胞分裂。动力蛋白沿神经元轴突运输细胞器和微管片断的过程被称为轴浆运输。
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