1、合成cDNA的引物：合成cDNA引物时，通常采用随机六核苷酸引物能够有效地指导从RNA有效地合成第一链cDNA：
2、避免RNA酶的污染：在合成cDNA第一链时，应使用RNA酶抑制剂，进行RT-PCR时，用于合成cDNA第一链的RNA不会对PCR有影响，因此没有必要用碱或RNA酶处理；
3、不同来源的逆转录酶均可较好地用于第一链cDNA的合成，但不同来源的逆转录酶反应温度有所不同。如来自鸟类成髓细胞瘤病毒（AMV）与来自鼠白血病毒莫勒尼株（Mo-MLV）均可用于合成第一链cDNA，AMV要求的反转录温度为42℃，而Mo-MLV则要求37℃，相对而言，Mo-MLV比较适合于RT-PCR，但由于其作用的最适温度为37℃，较AMV的42℃低，因此，对于具有较高二级结构的RNA模板可能会带来不利的影响。
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