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在风湿性疾病患者中，抗核糖体P蛋白抗体几乎只对系统性红斑狼疮（SLE）特异，为SLE的标志性抗体。其与狼疮肾炎相关很普遍，与无肾炎等狼疮患者相比有统计学意义，抗核糖体P蛋白抗体滴度升高合并有抗ds-DNA抗体在有肾炎的患者中尤为显著。抗核糖体P蛋白抗体的效价升高在SLE相关慢性活动性肝炎中高度特异性，区别于抗平滑肌抗体阳性，先天性慢性自身免疫活动性肝炎。在其它自身免疫病患者中很少发现抗核糖体P蛋白抗体滴度的升高。
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