DNA双螺旋结构的特征

（1） DNA由两条反向平行的多聚脱氧核苷酸链形成右手螺旋：一条链的5’-3方向是自上而下，而另一条链的3’-5’方向是自下而上，称为反向平行，它们围绕着同一个螺旋轴旋转而形成右手螺旋。

（2）由脱氧核糖和磷酸基团构成的亲水性骨架位于双螺旋结构的外侧，而疏水的碱基位于内侧。。

（3）位于DNA双链内侧的碱基以氢键结合，形成了互补碱基对：一条链上的腺嘌呤（A）与另一条链上的胸腺嘧啶（T）形成了2个氢键；一条链上的鸟嘌呤（G）与另一条链上的胞嘧啶（C）形成了3个氢键这种碱基配对关系称为互补碱基对，DNA的两条链则称为互补链。 

（4）碱基对平面与双螺旋的螺旋轴垂直，每两个相邻的碱基对平面之间的垂直距离为0. 34 nm，每一个螺旋含有10.5个碱基对，螺距为3.54 nm，DNA双螺旋结构的直径为2. 37 nm。从外观上，DNA双螺旋结构的表面存在一个大沟（major groove）和一个小沟（ minor groove），大沟是蛋白质识别DNA碱基序列发生相互作用的基础。

（5） DNA双螺旋结构的稳定主要依靠碱基对之间的氢键和碱基平面的疏水堆积力共同维持。相邻的两个碱基对平面在旋进过程中会彼此重叠（ overlapping），由此产生了疏水性的碱基堆积力（ base stacking interaction）。这种碱基堆积力和互补链之间碱基对的氢键共同维系着DNA双螺旋结构的稳定，并且前者的作用更为重要。