目前该病的病因及发病机制尚不明确。1985年有学者在SNN组织周围找到营养血管而推测为小的海绵状血管瘤发生纤维硬化后的结果。部分学者认为肝孤立性坏死结节可能是由创伤引起或由某些良性病变演变而来。变有认为可能为血管病变、感染或免疫反应等造成肝组织凝固性坏死，继而出现纤维包裹所致。
SNN的病理特点为纤维组织包裹的结节状凝固坏死灶，病灶中央可见坏死炎细胞，纤维包膜有较多淋巴细胞、浆细胞和单核细胞浸润，周围肝小叶结构完整，汇管区内有少量炎细胞浸润。本病的病因及发病机制尚不清楚，推测为血管病变、感染或免疫反应等因素造成肝组织凝固坏死团块，继而出现机体防御反应，纤维包裹凝固坏死团块并使之局限化。其发生是否与乙肝病毒感染有关尚不清楚，在这方面需要做更多的观察和研究。
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