接种流感疫苗是避免患流感最有效的方法。由于流感病毒经常变异，疫苗使用中的主要问题是毒种的选择，制造疫苗的毒株力求接近流行株。每年9月和2月，WHO全球流感规划小组分别建议南半球通常5～6月开始和北半球11～12月开始的下一个流感流行季节使用流感疫苗的成分。成分是基于国家流感中心和WHO合作中心的全球网络的监测资料。现行流感疫苗含有2个亚型甲型流感病毒抗原(H3N2和H1N1)和1个乙型流感病毒抗原。这些疫苗有3种类型，

　　1、全病毒疫苗由整个灭活的病毒构成，所以副作用也比较大。接种全病毒体疫苗的方法已经在很大程度上被其它方法所取代。

　　2、裂解病毒疫苗由经去污剂处理裂解的病毒颗粒组成，裂解流感疫苗包括表面抗原、血凝素、神经氨酸酶、核蛋白和基质蛋白等成分。此疫苗适合于成年人和儿童。

　　3、亚单位疫苗 主要由已去除其他病毒成分的、只产生抗体保护反应的HA和NA组成。由于纯度较高，安全性和耐受性均较强，尤其适用于儿童。

　　流感疫苗通常不加佐剂。但最近欧洲联盟已批准一种亚单位疫苗，含有新型水包油佐剂(MF59)。此种疫苗似对老年人可增强抗体应答，但这一研究结果的临床意义需要进一步阐明。流感活疫苗已在前苏联和其他一些国家使用。流感活疫苗的鼻腔应用试验目前正在美国进行。

　　现有灭活流感疫苗对高危人群的有效性已被证实，但其保护期有限，每年均需接种，并在注射后可能的副反应，以及缺乏局部和细胞免疫，促使研制一种喷雾型减毒流感活疫苗。在早期，前苏联和日本都研制过喷雾型减毒流感活疫苗，但报道的的有效性数据不能令人信服。最近，冷适应和重配病毒株经过较周详的试验，取得极好的效果。儿童试验表明高度有效，成人试验表明活疫苗对灭活病毒的免疫原性有协同作用。

　　接种流感疫苗能预防流感病毒感染，不能够预防禽流感病毒。但根据WHO“关于在H5N1病毒感染高危人群中应用流感疫苗的指引”，流感疫苗虽然不能保护接种者免除H5N1高致病性禽流感病毒的感染，但却能降低接种者同时感染人和禽流感病毒病毒的机会，从而降低流感病毒发生病毒基因重组的机会并降低可能出现新型流感病毒大流行的危险性。