基因重组是造成基因型变化的核酸的交换过程，是生物体内细胞中DNA序列的改变。基因重组是在生物体进行有性生殖的过程中，控制不同性状的基因重新组合。
基因重组一般发生在减数分裂过程中，包含两种情况，一种是减一后期同源染色体上的等位基因彼此分离，非同源染色体上的非等位基因彼此结合；另一种情况是联会时期的交叉互换。除此之外，基因工程也可以看做特殊情况下的基因重组，例如基因工程中,人们将目的基因加到运载体上再导入受体细胞,这也属于基因重组。基因重组只能产生新的基因型不能产生新基因，是生物变异的主要来源（注意不是根本）。
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