针对16S rRNA 保守序列设计引物，通过 PCR 扩增，可以将牛奶中嗜冷菌扩增出147bp的 DNA片段，标记后用 ELISA 检测，得到荧光假单胞菌AH-70 的OD450和菌浓度的方程，分析得此方法和平板计数法的相关系数达到 0.94，可以检测菌浓度范围是103-107CFU/mL。PCR 检测具有很高的灵敏度，特异性较强，有文献报道当原料奶中埃希肠杆菌的浓度达到 10CFU/mL 时能被检测出来。PCR 检测菌落数结果同样会受到死菌株数的影响，而且在现实生产中对食品提取可以PCR扩增的DNA难度很大，容易被食品体系中因素影响精确度。
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