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同位素核质量的不同使原子或分子的能级发生变化，引起原子光谱或分子光谱的谱线位移。
核自旋的不同，引起光谱精细结构的变化。如果分子中某些元素一部分被不同的同位素取代，从而破坏了分子的对称性，则能引起谱线分裂，并在红外光谱和并合散射光谱的振动结构中出现新的谱线和谱带。
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