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该基因是调节糖异生的主要控制点。由该基因编码的胞浆酶与GTP一起,催化草酰乙酸生成磷酸烯醇丙酮酸,并释放二氧化碳和GDP。该基因的表达可由胰岛素、糖皮质激素、胰高血糖素、环腺苷酸和饮食调节。这个基因的缺陷是导致胞浆磷酸烯醇丙酮酸羧激酶缺乏的原因。编码蛋白的线粒体同工酶也已被鉴定。