衣原体（Chlarmydia）介于立克次氏体与病毒之间，能通过细菌滤器，专性活细胞内寄生的一类原核生物。在宿主细胞内发育繁殖，具有独特周期：存在基本小体（elementary body）和初始体（initial body）两种形态。前者呈圆形颗粒状，直径约300纳米，含有一个原核和许多核糖体，并被包在多层壁中，有高度感染性；后者是由前者逐渐增大而成，是一个具有薄壁的网状球形体，是营养形式，以二分裂方式进行胞内繁殖，形成大量始体，无核，离开宿主细胞便无感染力。衣原体细胞主要由蛋白质、核酸、脂类及多糖组成，蛋白质中缺乏精氨酸和组氨酸，在繁殖过程也不需要这两种氨基酸；虽有一定的代谢活力，但缺乏产生能量的系统，必须依赖宿主获得ATP；不耐热，60℃、10分钟可被杀死，对化学药物及抗生素敏感。衣原体属现只承认两个种，即沙眼衣原体（C.tracho-matis）和鹦鹉热衣原体（C.psittaci）。
支原体是比衣原体还要小的病原体，除引起生殖道的感染外，还可引起肺炎。在致病微生物中，细菌较衣原体大，衣原体较支原体大，而支原体又较病毒大。所以说衣原体和支原体是间乎于细菌和病毒之间的微生物。
支原体是最小的能独立生活的原核生物。能引起人类疾病的支原体称为人类支原体。支原体大小为200nm，它没有坚硬的细胞壁结构，因而在形态上呈现多形性。
人类至少是11种支原体的自然宿主，而5种支原体（肺炎支原体、人型支原体、解脲支原体、生殖道支原体和隐匿支原体）对人类有致病性。人的生殖道支原体病是由人型支原体、生殖道支原体和解脲支原体引起的。支原体肺炎全年均可发病，以冬季多见，主要通过飞沫传播，潜伏期较长，可达2～3周。生殖器支原体感染是近年新明确的一种性接触传播疾病。成人主要通过性接触传播，新生儿则由母亲生殖道分娩时感染。成人男性的感染部位在尿道粘膜，女性感染部位在宫颈。新生儿主要引起结膜炎和肺炎。
支原体实验室检测方法有：形态学检查、支原体培养、抗原检测、血清学方法和分子生物学方法。
支原体比细菌对外界环境的抵抗力弱，45℃ 15分钟即被杀死，对肥皂、酒精、胆盐、四环素、红霉素、卡那霉素等敏感。由于青霉素的作用是抑制细菌的细胞壁合成，所以青霉素对支原体是无效的。
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