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DNA连接酶主要用于基因工程，将由限制性核酸内切酶"剪"出的粘性末端重新组合，故也称"基因针线"。
人教版高中生物选修3中提到的E·coliDNA连接酶，来源于大肠杆菌，可用于连接粘性末端;T4DNA连接酶，来源于T4噬菌体，可用于连接粘性末端和平末端，但连接效率低。
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